Zamjenici Predsjednice Komore zamjenjuju Predsjednicu Komore u slučaju njezina izbivanja ili spriječenosti, i obavljaju druge poslove koje im Predsjednica povjeri.
Zamjenici predsjednice Komore su Olgica Velkovski Škošić, mag.pharm. i izv.prof.dr.sc. Ivan Pepić, mag.pharm., Farmaceutsko-biokemijski fakultet u Zagrebu.