Nadzorni odbor obavlja nadzor nad financijskim, materijalnim i računovodstvenim poslovanjem Komore te nadzire zakonitost odluka koje donose tijela Komore.
Nadzorni odbor sastoji se od predsjednika, dva člana, zamjenika predsjednika i dva zamjenika člana.
Članovi nadzornog odbora su:
- Miroslav Kota, mag.pharm.
- Bojana Menkadžiev, mag.pharm.
- Olgica Velkovski Škopić, mag.pharm.
- Lidija Dimitrovski, mag.pharm.
- Alica Miler, mag.pharm.
- Marina Marušić Fojs , mag.pharm.