Izvršni odbor Komore čine: Predsjednik Komore, zamjenik Predsjednika Komore, jedan član Vijeća izabran od Vijeća Komore i jedan zastupnik Glavne skupštine izabran od Glavne skupštine Komore.
Izvršni odbor obavlja sljedeće poslove:
- izvršava zaključke i odluke Vijeća Komore
- priprema materijale, informacije, analize i prijedloge za Glavnu skupštinu i Vijeće Komore
- daje prijedlog Poslovnika o radu Izvršnog odbora
- utvrđuje prijedloge općih akata i provedbenih propisa Komore
- izrađuje i daje mišljenja Vijeću Komore kod pripreme nacrta propisa iz oblasti zdravstva
- razmatra problematiku ugovaranja ljekarni sa Hrvatskim zavodom za zdravstveno osiguranje i drugim osiguravateljima
- obavlja i druge poslove utvrđene Statutom i drugim općim aktima Komore
Članovi Izvršnog odbora su:
- Ana Soldo,
- Jasminka Vugec Mihok,
- Ivan Pepić,
- Kamilo Rudeš,
- Alen Neziri,
- Marija Vinković.